Nació en 1892 en La Plata. Ingresa en la Academia Provincia de Bellas Artes. En 1910 realiza una exposición de caricaturas y en 1911 otra de paisajes. En 1913 es becado a Florencia donde se encontrará con Martinetti y los futuristas. Luego expone en Italia y Alemania. Ya en París se encuentra con Xul Solar. Luego de varios viajes por Uruguay y Estados Unidos, vuelve a Europa en 1952 instalándose en París y ya volcado a la abstracción pictórica. Expone en Florencia y en Londres. En 1967 obtiene el Premio Fondo Nacional de las Artes. Sus obras recorren los museos de Baden-Baden, Bonn, Nuremberg, Essen y Berlín. En 1968 se realiza en el Palais de Beaux Arts la exposición “Emilio Pettoruti”. Publica sus memorias con el título “Un pintor ante el espejo”. Regresa definitivamente a la Argentina. En 1971 la XI Bienal de San Pablo incluye una sala especial dedicada a Pettoruti, con obras del período 1914/24. El 16 de octubre fallece en París.